Экспериментальная площадка по данной теме начала свою работу в 2005 г., предпосылки для ее открытия создавались с 2002 г. В 2009 г. она завершила свою работу в связи с достижением сроков окончания эксперимента.

В ее рамках был разработан и осуществлен аналитический подход к проектному обучению программирования в школе, основывающийся на сопоставлении современного уровня и тенденций в разработке ПО, особенностей вузовского, школьного и самостоятельного видов обучения, возрастных и психологических особенностей учащихся. Подход рассчитан на сильных мотивированных учеников физико-математических классов и школ. Выпускники профиля, даже "слабые троечники", не имеют проблем с информатикой и программированием в вузах, ряд учеников занял высокие и призовые места на всероссийских и международных конференциях. Было разработано методическое и программное обеспечение для сопровождения работы площадки, проведены мастер-классы и занятия с учителями (в том числе зарубежными) с высокой оценкой их результатов. Совместно с кафедрой физики была создана и активно проводилась школьная научная конференция, в которой компьютерная секция неизменно собирала наибольшее число участников и слушателей.

По оценке многих специалистов, ознакомившихся с методикой, в том числе ведущих специалистов в области компьютерного вузовского образования, декана ФУПМ МФТИ, проф. А.А. Шананина и зав. кафедрой информатики МФТИ И.Б. Петрова,лауреатов премии Президента России, сотрудников СПбГУ ИТМО ректора акад. В. Н. Васильева, проф. В. Г. Парфено­ва, проф. А. А. Шалыто и их сотрудников, разработанная версия проектного подхода является инновационной (по формулировке ИТМО – уникальной), частичные аналоги ее существуют, но системного комплексного анализа в сочетании с ориентацией на действительно современный промышленный уровень разработки ПО не демонстрируют. Оценка деятельности экспериментальной площадки дана ими в письме руководителю департамента образования Москвы О. Н. Ларионовой от 04.04.2009 г.

В рамках профиля были осуществлены тесные контакты, заключены соглашения и договора с МФТИ, МГУ, Институтом системного программирования РАН и другими научными и учебными организациями.

Профиль первоначально был рассчитан на 7-11 кл. и подразумевал учебную нагрузку 4-6 час. в неделю, затем она была уменьшена учебной частью до 4 часов. Далее в 2008 г. количество часов в 10-11 кл. было уменьшено до общеобразовательной нормы 2 час. в неделю, что поставило преподавание профильного материала в критическое положение: учащиеся именно в 10 кл. набирали уровень, позволявший им успешно участвовать во всероссийских и международных конкурсах. В 2010 г. сокращение продолжилось: теперь оно коснулось 9 кл., и теперь "расширенная программа" - это всего лишь 2 начальных года образования.

В 2010 учебном году администрацией лицея был прекращен набор в углубленные группы по программированию, а учащимся некоторых классов администрацией было поставлено условие не посещать факультативные занятия по данной тематике. В 2011 г. набор возобновился, но администрацией были значительно сокращены занятия на основе котороых проводился отбор в группы, вследствие чего он стал почти случайным.

Компьютерный класс, в котором проводятся профильные занятия, оснащен устаревшей техникой, работающих компьютеров хватает на половину группы учащихся. Модернизация кабинета администрацией не проводится, хотя в других кабинетах устанавливается современная компьютерная техника.

В 2012 г. был изменен формат проведения научно-практической конференции им. Р. К. Бега - ведущего мотиватора и трамплина для участия школьников в дальнейших конференциях на тему технологий программирования. Жаль, что когда другие лицеи Москвы развивают и расширяют такие конференции, во "Второй школе" она превратилась в кулуарный одноразовый семинар для докладчиков и "успешных учеников, не имеющих задолженностей", и, таким образом, перестала быть существенным мотиватором деятельности. В последние 3 года управление конференцией взял на себя зам. дир. А. К. Ковальджи, и это время ознаменовалось ее упадком.